与此同时，留守宁波的王如龙传来急报：有一队伪装成渔民的倭寇，携带密封竹筒试图突破防线。林远亲自带队拦截，在甬江入海口展开激烈追逐。当倭寇船只被炮火击中，一名武士跳海前将竹筒塞进嘴里，林远果断下令放箭。箭矢穿透武士咽喉的瞬间，竹筒坠入水中，锦衣卫潜水打捞上来时，发现里面竟是用薄如蝉翼的绢布绘制的齿轮装置分解图。

然而，危机并未解除。暗影小组从琉球传回密报：倭寇在当地的据点已启用信鸽传递情报，且航线经过葡萄牙控制的马六甲海峡，难以拦截。林远陷入沉思，突然想起毛海峰曾说过，五峰船团在琉球海域设有“听风站”——由经验丰富的水手监听海上动静，通过特殊的海螺号声传递信息。

他立刻与毛海峰商议，在信鸽必经之路上设下天罗地网。五峰船团的快船伪装成商船，甲板下暗藏捕鸟网；物流学堂则改良了弩机，加装瞄准镜和连发装置。三日后，当信鸽群掠过海面时，弩箭破空而出，捕鸟网如乌云般笼罩天空。最终，锦衣卫在一只信鸽的腿上，发现了加密的情报纸条。

破译工作由物流学堂最顶尖的算术师负责。他们发现倭寇采用了葡萄牙人的密码体系，将图纸转化为数字代码。经过两天两夜的推算，众人惊觉情报中不仅包含战船技术，还有宁波港的布防图，甚至海运联盟与五峰船团的合作细节。林远冷汗直流——若这些情报送达日本，后果不堪设想。

就在此时，苏婉娘神色匆匆送来新线索：“掌柜，物流学堂的杂役老周失踪了，他曾接触过齿轮装置的组装！”林远立即调集人手搜索，最终在港口的废弃船舱里发现了昏迷的老周，他身旁散落着未写完的图纸。原来老周察觉有人跟踪，为保护技术，将图纸吞入腹中，却遭倭寇袭击。

深夜，林远站在物流监查司的屋顶，望着港口巡逻的灯火。海风掠过他身后的“国之柱石”牌匾，发出呜咽般的声响。苏婉娘抱着新截获的密信走来：“倭寇改变策略，准备派忍者潜入泉州海军学堂...”话音未落，远处突然响起急促的警报声，林远握紧腰间令牌，朝着声音传来的方向奔去，夜色中的港口，新一轮的较量已经拉开帷幕。